No dia 19, um encontro de integração e alinhamento metodológico reuniu na Embrapa Agricultura Digital a equipe multidisciplinar e interinstitucional que testa a abordagem de monitoramento da biodiversidade baseada no uso de DNA ambiental, conhecido como eDNA, em áreas da Mata Atlântica.

A ação é desenvolvida no âmbito do Centro de Ciências para o Desenvolvimento em Agricultura Digital (Semear Digital), voltado a pequenas e médias propriedades rurais e coordenado pela Unidade. A iniciativa conta também com o financiamento do SEG no projeto eDNA Rural: “Produção Rural Sustentável: Aliando Agricultura e Biodiversidade em Pequenas Propriedades Rurais na Mata Atlântica com o uso de DNA ambiental (eDNA)”

O objetivo é investir na criação de métricas relacionadas à biodiversidade e aos serviços ecossistêmicos que comprovem os benefícios ambientais da manutenção da floresta em pé, valorizando economicamente produtores que preservam áreas nativas, destaca Vanessa Suguiyama, pesquisadora da C3 Ambiental com quem a Unidade mantém acordo de cooperação técnica. A parceria no desenvolvimento do estudo ocorre como parte do programa Floresta & Carbono, em Lagoinha e Jacupiranga, municípios paulistas que integram o Semear Digital como Distritos Agrotecnológicos (DATs).

Além de pesquisadores da Unidade e da Embrapa Meio Ambiente, o encontro contou com cerca de 20 especialistas da Universidade Federal do ABC, Esalq/USP, Instituto Chico Mendes de Conservação da Biodiversidade (ICMBio) e do Instituto Tecnológico Vale (ITV). E, ainda, de empresas parceiras que falaram sobre as etapas em que atuam no desenvolvimento dos trabalhos: EcoMol, Illumina, além da C3 Ambiental

Ao longo da reunião, foram detalhadas as etapas do processo de monitoramento desde a escolha da área da propriedade em que será feita a coleta do DNA – que conta com a colaboração do agricultor. Passando pelos cuidados para evitar contaminação de amostras, do campo até o laboratório – onde o DNA é extraído, purificado, amplificado por meio de marcadores taxonômicos específicos e sequenciado. A identificação das espécies ocorre por comparação das sequências com bancos de dados genéticos de referência.

Próximos passos
A coordenação do projeto, parceiros e participantes foram unânimes em destacar a importância do encontro presencial para o alinhamento metodológico da equipe multidisciplinar do projeto e nivelamento de expectativas. “Faremos as campanhas de campo nos próximos meses tanto no DAT Lagoinha quanto no DAT Jacupiranga, bem como ações de capacitação com produtores rurais em ambas as regiões”, diz a pesquisadora da Embrapa Agricultura Digital Poliana Giachetto, coordenadora do projeto eDNA.

As campanhas de campo vão dar robustez aos resultados, diz a especialista em biodiversidade da UD, Debora Drucker. “Assim, será possível aprimorar a capacidade de monitorar a biodiversidade baseada no uso de eDNA em propriedades rurais na Mata Atlântica”, completa.

Cerca de 53% da vegetação nativa brasileira ocorre em propriedades privadas e a biodiversidade dentro de Unidades de Conservação (áreas protegidas) é mais estudada e conhecida, destaca a analista da Embrapa Agricultura Digital, apontando a relevância do projeto.

eDNA
Priscilla Villela, fundadora da EcoMol, responsável pelas análises laboratoriais, padronização das coletas em campo e capacitação apresentou experiências e aplicações do eDNA metabarcoding no monitoramento da biodiversidade. Todos os organismos deixam vestígios de DNA por onde passam através de células, pontuou.

“O eDNA é o DNA extraído diretamente do ambiente e o iDNA é o DNA obtido de vetores como sanguessugas, mosquitos ou besouros”, explicou destacando os conceitos. Entre as vantagens das tecnologias apontou o fato de detectarem múltiplas espécies, inclusive discretas ou raras, e não serem invasivas. As amostras são constituídas do DNA extraído da água, do solo, do ar, e até teia de aranhas sem a necessidade de coletar um organismo, disse.

Com a apresentação “Do DNA à informação biológica: amplificação, sequenciamento e interpretação do eDNA”, Jeniffer Teles, bolsista do projeto, detalhou os procedimentos e técnicas de coleta por tipo de substrato. A pesquisadora indicou as principais bases de dados de referência de eDNA e tirou dúvidas dos participantes.

Genômica
O gerente Phelipe Toledo da Illumina, que atua com genômica aplicada à agrobiodiversidade, apresentou o funcionamento da tecnologia da empresa, desde os equipamentos até as soluções para o sequenciamento de DNA de nova geração, além do suporte científico e técnico. “A principal vantagem para quem trabalha com esse tipo de projeto, de descoberta e de análise, é trabalhar com a certeza de que você está vendo exatamente o que tem na amostra, a acurácia”, avaliou Toledo. A velocidade no alcance das análises e resultados também foram apontados como benefícios da técnica.

Segundo o gerente, o encontro ajudou a equipe que trabalha no projeto a visualizar melhor as particularidades da tecnologia e como ela se comporta, para, então, avaliar a importância de sua aplicação na obtenção dos insights científicos.

Valéria Cristina Costa (MTb.15533/SP)
Embrapa Agricultura Digital
valeria.costa@embrapa.br